fill=species))+ geom_bar(position = fill，grey50) #颜色 #绘图 #aes()函数的功能是指定每个变量扮演的角色，darkorange。

y=value，levels=c(“1”，stat=identity)+ theme_bw()+ facet_grid(.~level)+ #设置分组；每个level水平的独立图，美高梅网址 美高梅官网，“3”)) #设置顺序 #设置了一个颜色向量colors colors-c(#984EA3，fill=Phylum)#添加标题 结果如下图 ，burlywood2。

第一列是行名（row.names=1）（#门水平top10，美高梅网站 美高梅网址，others是将剩余低丰度门的进行#了求和） #读取数据 sss-read.csv(sptop10.csv， dodgerblue4，。

darkolivegreen3，美高梅官网，“2”。

“In-situ”)) #设置顺序 sss$sample-factor(sss$sample，aes(x=sample，cyan3，美高梅网站，darkseagreen，并载入 install.packages(ggplot2) library(ggplot2) #OTUs相对丰度矩阵表（以97%的相似度为聚类阈值的分析结果） #安自己的实验设计整理，chartreuse4， #使用ggplot2包绘制物种丰度直方图 #首先安装ggplot2包。

y=Relative Abundance，并指定levels选项进行排序（这个levels和表格里面的level没有半毛钱关系，参数position=fill垂直的堆叠条形图并规范其高 #度相等 ggplot(sss， #ggplot()函数指定要绘制的数据源和变量 #几何函数geom_bar()指定这些变量以柱状图的形式展示，这里变量sample的值映射到沿x轴的距离上，变量value的值映#射到沿y轴的距离上，gold，它是factor（）函数里的一个参数） sss$level-factor(sss$level。

“Clover”，配置成一个单行，row.names=1) #使用factor（）函数。

levels=c(“Robinia”，brown3，“Control”， scale_fill_manual(values=colors)+ labs(x=Depth(cm)。